Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	938572	938595	24	243 [0]	[0] 14	ycaJ	recombination protein

ACCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGCC  >  W3110S.gb/938596‑938664 |                                                                     aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTTTTTCTGcc  <  1:1500108/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:1029820/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:1361176/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:1457372/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:1477082/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:1579027/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:234812/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:39130/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:431118/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:594940/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:601916/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:631936/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:714149/69‑1 (MQ=255) aCCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGcc  <  1:782970/69‑1 (MQ=255) |                                                                     ACCGGCAAAACAACTCTCGCTGAAGTGATTGCCCGCTATGCGAACGCTGATGTGGAACGTATTTCTGCC  >  W3110S.gb/938596‑938664

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑