Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	968962	969579	618	42 [0]	[0] 71	lpxK	lipid A 4'kinase

CAGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGA  >  W3110S.gb/969580‑969644 |                                                                 caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTa                               >  1:1106274/1‑36 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTGAGCGACGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:965464/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAgc                            >  1:14581/1‑39 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCaa                   >  1:362441/1‑48 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTg   >  1:956906/1‑64 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTg   >  1:1542352/1‑64 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTg   >  1:881100/1‑64 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTg   >  1:1277595/1‑64 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTg   >  1:302711/1‑64 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:679674/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:463427/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:677008/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:647287/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:623640/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:613216/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:60222/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:572582/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:555300/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:552564/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:486865/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:480639/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:466800/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1054441/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:698740/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:733604/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:976543/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:756756/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:790366/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:814696/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:832820/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:843948/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:852877/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:872013/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:875609/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:910015/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:915666/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:92840/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:941767/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1273805/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1428519/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1427870/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1424152/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1391033/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1370000/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1355117/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1303093/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1276754/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1477495/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1240186/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:120909/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1186924/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1133433/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1132643/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1116460/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1113956/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:459979/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1551640/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1577337/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:158775/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1600876/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:1896/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:198037/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:253247/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:268262/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:326896/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:331083/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:336651/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:395655/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:437404/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGa  >  1:447081/1‑65 (MQ=255) caGTCTTTGAACAATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTg   >  1:495220/1‑64 (MQ=255) |                                                                 CAGTCTTTGAACCATGCGGATGTCAGTGCGTTGGTAAGCGCCGGGCAAACGCTGGTAATGACTGA  >  W3110S.gb/969580‑969644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑