Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1020356	1020530	175	126 [1]	[0] 59	[ompA]	[ompA]

ACGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGC  >  W3110S.gb/1020531‑1020599 |                                                                     acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCg                        >  1:1089033/1‑47 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCt            >  1:556814/1‑59 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTa          >  1:600747/1‑61 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCgcgc  >  1:1341096/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCgcgc  >  1:589337/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCg     >  1:1551974/1‑66 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAg   >  1:388945/1‑68 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAg   >  1:1111577/1‑68 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:484506/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:673504/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:574193/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:572638/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:384390/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:476127/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:43931/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:421388/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1086028/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:694078/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:703057/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:708909/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:721391/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:743139/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:801886/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:802932/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:892725/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:899677/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:938649/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:943213/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:94846/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:973668/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:995830/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1391648/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1015847/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1087984/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1094025/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1139199/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1166304/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1172045/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1226443/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1228632/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1254702/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:128415/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1331969/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1364545/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:276682/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1421735/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1472549/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1490244/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1528482/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1539318/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1555052/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1559131/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1602943/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:1604637/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:160571/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGc  >  1:260335/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCCAGc  >  1:1270837/1‑69 (MQ=255) acGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTACGCCGAGc  >  1:501052/1‑69 (MQ=255) acGGGTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATAtt                                  >  1:1605778/1‑37 (MQ=255) |                                                                     ACGGTTAAATCCTTCACCGGGGGATCTGCTCAATATTAACTCTACCGATATCTTCGGCTTATGCCGAGC  >  W3110S.gb/1020531‑1020599

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑