Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1091273	1091669	397	175 [0]	[0] 78	ycdS	predicted outer membrane protein

GGGCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCT  >  W3110S.gb/1091670‑1091737 |                                                                    gggCAATGGTCTTCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:105342/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATTATCt  <  1:1333274/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:354699/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:478872/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:473467/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:449152/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:418511/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:414387/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:406530/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:405505/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:375336/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:374897/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:505883/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:353638/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:284495/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:274792/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:27325/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:229251/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:200023/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:191091/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1564701/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:862524/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:994085/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:984768/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:970527/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:964342/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:944292/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:904110/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:902434/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:868581/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:86299/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1562304/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:826504/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:824746/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:775607/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:764501/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:722542/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:66183/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:612806/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:508531/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1128240/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1009443/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:126007/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:120572/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1188550/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1166818/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1142597/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1139385/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1138473/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1270089/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1104357/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1103840/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1100929/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:109759/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1088091/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1086587/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1044417/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1030336/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1413775/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:15615/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1561354/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1559478/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:155411/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1548222/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:15324/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1519395/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1516138/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1514380/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1300778/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1402019/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1382650/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1334133/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1330885/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1328633/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1327214/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:1320910/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGGCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:857306/68‑1 (MQ=255) gggCAATGGTCTCCTTGTGAAAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCt  <  1:117722/68‑1 (MQ=255) |                                                                    GGGCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCT  >  W3110S.gb/1091670‑1091737

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑