Missing coverage evidence...
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CCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGC  >  W3110S.gb/1169092‑1169140 |                                                 cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCtt         >  1:550852/1‑42 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTg   >  1:1604953/1‑48 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:569692/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:344262/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:352973/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:380145/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:391320/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:393661/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:398414/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:414893/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:415707/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:43124/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:484041/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:510312/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:520095/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:291034/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:588402/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:608859/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:646082/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:698816/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:741199/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:821728/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:829467/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:844360/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:857245/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:860201/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:879867/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:903146/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:929861/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:949831/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:289523/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1045916/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1141794/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:120934/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1259108/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1269098/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1309633/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1316750/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1345694/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1352090/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1373055/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1385123/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1430647/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1443379/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1493998/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1499250/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1504325/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1512335/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1567157/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1584695/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1590885/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:164054/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:213531/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:23980/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:266737/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1045507/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCCCCTTCGCTTGc  >  1:1493053/1‑49 (MQ=255) cccGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGACAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGc  >  1:1462310/1‑49 (MQ=255) |                                                 CCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGC  >  W3110S.gb/1169092‑1169140

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑