Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1173166	1173674	509	46 [1]	[0] 93	mfd	transcription‑repair coupling factor

CCATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTT  >  W3110S.gb/1173675‑1173742 |                                                                    ccATTGCCAGCGGCTGATACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:90480/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACCCATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:342172/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTg                     >  1:1202182/1‑49 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTg               >  1:1132335/1‑55 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGa              >  1:1343815/1‑56 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATcc           >  1:512585/1‑59 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:402317/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:554789/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:54636/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:543717/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:531855/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:522445/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:51011/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:493957/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:465395/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:442011/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:424659/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:626967/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:400289/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:368985/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:342114/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:33542/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:332809/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:327993/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:317466/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:312930/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:731741/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:93423/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:931611/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:907110/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:87546/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:822357/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:764137/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:741731/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:736990/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:73332/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:732990/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:584503/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:71825/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:715808/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:712283/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:70168/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:686785/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:663733/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:645922/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:631554/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:290263/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:613692/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1240174/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1350897/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1340388/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1338395/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1334536/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1315848/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1308071/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1306584/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1301394/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1274429/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1265542/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:135945/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1196790/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1171127/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1131328/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1130438/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1122955/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1119918/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1095306/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1078202/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1049511/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1036006/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1370811/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:101363/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:277246/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:258789/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:248361/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:22211/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:211274/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:203931/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1598390/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1583287/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1542778/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1525382/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1459669/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1454561/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:143744/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1415901/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:141529/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1411745/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:1387840/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGtt  >  1:312002/1‑68 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGt   >  1:155947/1‑67 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGt   >  1:704610/1‑67 (MQ=255) ccATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCCTGGtt  >  1:1532362/1‑68 (MQ=255) |                                                                    CCATTGCCAGCGGCTGACACATGTCGCTAAGTACCGCATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTT  >  W3110S.gb/1173675‑1173742

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑