Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1241982	1242587	606	29 [0]	[0] 81	cvrA	predicted cation/proton antiporter

ATCGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCA  >  W3110S.gb/1242588‑1242656 |                                                                     atcGGGAACACGGCCAGGATGATTTGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:458830/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCGAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:504021/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTct  <  1:406866/69‑2 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:456462/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:570755/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:569313/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:566450/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:52475/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:52221/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:50546/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:502999/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:496578/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:616326/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:435421/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:423359/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:408665/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:392039/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:384408/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:325263/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:303536/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:299132/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:857973/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:991414/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:990348/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:946781/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:936155/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:921598/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:910090/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:896961/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:874702/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:86955/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:288587/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:79453/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:773125/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:732198/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:710335/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:690040/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:65328/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:648791/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:629140/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:628321/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1183879/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1298447/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1291671/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1278802/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1260539/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1253801/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:125236/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:124400/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1208740/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1194353/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1330458/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1174669/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1147674/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1137124/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1126557/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1094876/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1090943/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1018094/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1018011/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1011751/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1522089/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:268929/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:214069/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:201973/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:181626/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1603674/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1600736/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1564862/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:155524/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1523103/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1004168/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1466188/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:144320/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1436292/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1423850/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1413864/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1411449/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1367076/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1366047/69‑1 (MQ=255) atcGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCa  <  1:1350902/69‑1 (MQ=255) |                                                                     ATCGGGAACACGGCCAGGATGATTGGCACCGCGCCGCGTAATCCTACCCAGCTGATAAACACGCGCTCA  >  W3110S.gb/1242588‑1242656

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑