Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1277683	1278315	633	110 [0]	[0] 48	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

CATCATCAGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCG  >  W3110S.gb/1278316‑1278377 |                                                              catcttcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGcc   >  1:1074236/1‑61 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGTAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:165039/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCAGGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:960319/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAgg                    >  1:670167/1‑44 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGcc   >  1:255218/1‑61 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:660800/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:525700/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:552740/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:581783/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:601430/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:607814/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:623366/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:628290/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:632884/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:638751/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:642320/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:468640/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:706740/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:709341/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:755538/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:781578/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:8647/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:865363/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:956666/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:97022/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:991464/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1552489/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1069377/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:112264/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1157624/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1243763/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1249746/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1297553/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1336914/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1459987/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1462873/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1495338/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:525109/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1565436/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1566291/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:172089/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:248974/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:332907/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:363285/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:388412/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:426578/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:448311/1‑62 (MQ=255) catcatcaGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCg  >  1:1034429/1‑62 (MQ=255) |                                                              CATCATCAGTGTCATACACCCGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCG  >  W3110S.gb/1278316‑1278377

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑