Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1332438	1332605	168	34 [0]	[0] 93	yciN/topA	hypothetical protein/DNA topoisomerase I, omega subunit

AGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCAGAGA  >  W3110S.gb/1332606‑1332674 |                                                                     aGACCTGTTAACTCAGTCACCTTAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:983009/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCggaga  <  1:379562/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:642574/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:29035/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:638199/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:627810/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:61656/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:596938/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:579546/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:578005/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:570920/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:53361/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:477963/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:465065/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:459209/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:448025/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:44326/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:424788/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:380900/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:351695/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:336959/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:32256/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:307694/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:283088/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:79499/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:977105/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:969548/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:964691/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:957660/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:938792/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:92746/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:901319/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:896657/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:818031/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:814807/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:680241/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:79390/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:758730/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:753205/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:738612/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:73316/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:722395/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:721822/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:712292/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:70691/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:697468/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1206981/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1419774/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1417984/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1403647/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1378139/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1375504/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1362133/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1345579/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1343938/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1326270/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1269811/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1230180/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1420774/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1195061/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1185925/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1152278/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1141312/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1130620/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1114818/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1074077/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1071446/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1047964/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1036506/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1570561/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:278684/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:274172/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:247799/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:246762/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:21034/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:172930/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:170555/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:165829/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:160418/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1592170/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:157595/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1009954/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1566060/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1556467/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1543263/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:150060/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1488622/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1485675/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1468479/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1437703/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGAAAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1507952/69‑1 (MQ=255) aGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTCAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:746688/69‑1 (MQ=255) aGACCCGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCagaga  <  1:1456700/69‑1 (MQ=255) |                                                                     AGACCTGTTAACTCAGTCACCTGAATTTTCGTGAACAGAGTCACGACAAGGGGTTGATATCCGCAGAGA  >  W3110S.gb/1332606‑1332674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑