Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1428887	1428892	6	73 [0]	[0] 77	ynaA	predicted tail protein

TTCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGTTACTCA  >  W3110S.gb/1428893‑1428961 |                                                                     ttCTCCTGATATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:298615/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAATTGTATGAGGAGCTTTCTGGAAATCTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1553263/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTg                              >  1:833811/1‑41 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGc                        >  1:354870/1‑47 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTTAGGt        >  1:762976/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAgg         >  1:1147024/1‑62 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAgg         >  1:238740/1‑62 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAgg         >  1:1595570/1‑62 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:357863/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:366802/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:407280/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:59794/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:333893/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:326683/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:412696/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:305885/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:415751/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:460360/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:461603/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:476293/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:526258/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:544175/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:861136/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1007482/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:966599/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:942442/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:926222/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:925719/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:922524/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:883579/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:880508/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:591558/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:775651/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:746458/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:72325/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:694058/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:665287/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:656161/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:608175/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:999709/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1213062/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1328536/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1327585/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1300386/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1291563/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1253463/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1248486/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1240475/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1232606/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1328570/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1200349/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1191292/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1190221/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1153775/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1153006/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1124948/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1067977/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:10468/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1597740/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:19277/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:177126/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:174665/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:165360/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1604733/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:278377/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1569914/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1510956/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1466713/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1394397/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1382483/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1368597/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:1349362/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGTTAcgga  >  1:1351132/1‑66 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGTTAcag   >  1:386873/1‑66 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTAGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:116999/1‑63 (MQ=255) ttCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTCGAAAACTTCGTGCTAt                          >  1:165272/1‑45 (MQ=255) ttCTCCGGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGt        >  1:4044/1‑63 (MQ=255) |                                                                     TTCTCCTGAAATGTATGAGGAGCTTTCTGGAAAACTTCGTGCTATGCGGAGTGAGCTTGAGGTTACTCA  >  W3110S.gb/1428893‑1428961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑