Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 1475066 | 1475141 | 76 | 119 [0] | [0] 158 | ydbA ydbA |
ECK1398:JW5802+JW1402:b4492; predicted outer membrane protein ECK1398:JW1402:b1405; predicted outer membrane protein, C‑ter fragment |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTG > W3110S.gb/1475142‑1475209 | tAACTGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:548112/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACTGCAGCCGCTCGATTg < 1:151984/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGGTCGATTg < 1:325293/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCTATTg < 1:1136309/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:430831/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:578258/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:572621/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:531657/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:520347/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:500212/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:492025/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:488151/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:481186/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:463322/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:435714/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:610323/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:419227/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:401842/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:382959/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:376099/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:375277/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:362735/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:353841/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:337160/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:30137/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:290311/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:78552/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:990658/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:967277/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:966862/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:944262/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:930622/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:892064/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:872748/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:867069/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:858681/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:811708/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:808485/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:285850/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:75253/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:747796/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:745986/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:741426/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:71903/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:702358/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:689450/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:673705/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:659269/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:650920/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:648771/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1196118/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1008149/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1341395/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:133671/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1318304/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1310315/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1289775/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1261494/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1240526/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1230664/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1224482/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1213997/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1206598/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1369197/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1182949/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1178622/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1144365/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1126232/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1123277/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1092777/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1081745/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1076776/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1067026/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1034145/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1015048/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1581659/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:270897/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:261341/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:256931/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:227788/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:226574/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:223908/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:214379/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:208582/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:184822/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1593023/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1393436/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1551435/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:151489/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1487798/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1481511/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1459014/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1428503/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1428096/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1424180/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:1420186/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:140165/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACACCAGCCGCTCGATTg < 1:91887/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTAACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:448669/68‑1 (MQ=255) tAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTGCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTg < 1:184412/68‑1 (MQ=255) | TAACGGCATGAACTGGAATAACGCCTTGCGTTACGACGTTCACAACCTTGACAGCAGCCGCTCGATTG > W3110S.gb/1475142‑1475209 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |