Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1525367	1525470	104	79 [0]	[0] 51	yncE	conserved hypothetical protein

GCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCG  >  W3110S.gb/1525471‑1525525 |                                                       gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:712387/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:112333/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:352072/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:365306/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:399065/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:41112/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:450560/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:461191/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:479203/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:47979/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:505912/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:607938/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:697471/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:230578/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:726219/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:734719/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:73638/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:786073/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:85592/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:860377/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:894140/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:895293/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:947418/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:994464/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:994963/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:226605/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1175640/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:117752/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1219948/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1248686/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:132049/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:134262/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1345/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1385148/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1401055/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1403156/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:146213/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1496615/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1501715/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1509047/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1541474/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1577419/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1579041/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1596116/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1134406/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:219223/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:223823/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGGCg  <  1:987299/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTAGGTCg  <  1:235824/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCGTTTACATCAGTGCTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:164778/55‑1 (MQ=255) gCCACGAACACCATTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCg  <  1:1129343/55‑1 (MQ=255) |                                                       GCCACGAACACCGTTTACATCAGTGGTATTGGTAAAGAGAGCGTGATTTGGGTCG  >  W3110S.gb/1525471‑1525525

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑