Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1536542	1536633	92	11 [0]	[0] 73	[nhoA]	[nhoA]

AGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGC  >  W3110S.gb/1536634‑1536702 |                                                                     aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGCCAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:217791/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGCCAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1096494/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCa                >  1:1501006/1‑55 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCgg   >  1:1104374/1‑68 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCgg   >  1:1117785/1‑68 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCgg   >  1:1428456/1‑68 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCgg   >  1:1452512/1‑68 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCgg   >  1:352175/1‑68 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCg    >  1:1076197/1‑67 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:560322/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:47991/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:465694/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:409070/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:398473/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:371965/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:356703/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:705052/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:316798/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:308063/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:303491/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:235383/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:249305/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:838586/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:943457/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:930957/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:928530/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:8850/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:870922/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:865919/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:852914/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:844989/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:602133/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:833579/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:829123/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:806864/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:748742/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:739777/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:71064/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1571003/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:615243/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1324467/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1009349/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1022028/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1079633/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1098676/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1128769/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1145667/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:114668/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1246102/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1266783/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1285299/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1294599/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1308753/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1309654/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1317865/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1323986/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1356350/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:182528/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1002653/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1547355/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1523043/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1496731/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1477991/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1454062/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1452994/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1428457/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1374194/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1363852/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1361530/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTATCAGAGTTCaaat             >  1:267834/1‑56 (MQ=255) aGCCCGGGTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1287854/1‑69 (MQ=255) aGCCCGGGTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTAGGc  >  1:387632/1‑69 (MQ=255) aGCCCGCTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGc  >  1:1933/1‑69 (MQ=255) |                                                                     AGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCATTCGGC  >  W3110S.gb/1536634‑1536702

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑