Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1543181	1543185	5	64 [1]	[0] 38	narZ	nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit

CTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGT  >  W3110S.gb/1543186‑1543253 |                                                                    cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTTAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:841920/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATTCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:696079/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:681741/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:35290/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:381772/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:439309/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:462022/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:516712/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:542933/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:566155/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:621058/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:621358/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:34320/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:703955/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:723600/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:815171/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:842162/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:847136/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:88829/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1351538/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1022167/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1140956/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1188885/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1188972/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1271970/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1283332/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1303782/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1314808/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1321560/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1012718/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1451399/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1458577/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1506447/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1546783/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:1569087/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:184296/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:284120/68‑1 (MQ=255) cTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGt  <  1:337435/68‑1 (MQ=255) |                                                                    CTGCGGATTGTTGCTTTCGCCCAGTCCATCCACCAGGTCAGATGCGCGGATCATGCGCCCGGGAACGT  >  W3110S.gb/1543186‑1543253

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑