Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1649385	1649692	308	139 [0]	[0] 68	[dicC]–[dicA]	[dicC],[dicA]

CGGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATC  >  W3110S.gb/1649693‑1649760 |                                                                    cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTagc  <  1:952474/68‑3 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:411542/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:614763/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:562433/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:530593/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:522638/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:501894/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:467665/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:435068/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:430244/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:637382/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:39258/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:392265/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:371254/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:369041/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:309442/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1056532/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:630284/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:299571/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:813256/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:822429/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:828350/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:828613/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:83697/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:840412/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:88137/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:881768/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:904416/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:931593/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:96119/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:97990/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:987552/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:994184/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1234231/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1326979/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1312235/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1309476/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1294467/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1290257/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1275727/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1253430/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:123544/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1358114/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1216378/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:121298/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1167641/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1164959/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1111372/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1096185/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1074977/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1358319/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:284265/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:224935/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:223904/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:195562/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1588189/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1552388/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1540339/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1481252/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1441006/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1405326/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1391477/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1381767/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1368038/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:294332/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGGCTGTATc  <  1:850617/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTCGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:1522795/68‑1 (MQ=255) cgGAAAAACCACAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATc  <  1:375955/68‑1 (MQ=255) |                                                                    CGGAAAAACCTCAAACACACCCAAAGGTCTCTTGCTAAAGCCCTGAAAATCTCCCATGTGTCTGTATC  >  W3110S.gb/1649693‑1649760

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑