Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1675005	1675012	8	62 [0]	[0] 48	mdtJ	multidrug efflux system transporter

CCGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACG  >  W3110S.gb/1675013‑1675063 |                                                   ccGATACCTTCCCATAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:131250/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:678590/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1564146/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:161233/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:166825/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:241373/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:308562/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:357672/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:397982/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:407435/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:542505/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:61608/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:6268/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1547022/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:701194/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:728856/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:755844/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:769647/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:799145/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:816313/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:823693/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:828958/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:908756/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:951466/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:964229/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1151200/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1011579/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1050893/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1053342/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1055848/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:106885/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1072495/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:108831/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1090744/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:109504/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1120431/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1143650/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1001348/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1153491/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1242831/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1309594/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1314195/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1355945/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1379674/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1407690/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1448863/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACg  <  1:1516786/51‑1 (MQ=255) ccGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATATTTTTAACg  <  1:124631/51‑1 (MQ=255) |                                                   CCGATACCTTCCCACAGCGCATAAGCTACGCCTAAGGCGATTTTTTTAACG  >  W3110S.gb/1675013‑1675063

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑