Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1756838	1756839	2	84 [0]	[0] 73	ydhZ	hypothetical protein

TTGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAG  >  W3110S.gb/1756840‑1756887 |                                                ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACTTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1550984/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCa   >  1:1399004/1‑47 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCa   >  1:433298/1‑47 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCa   >  1:1450592/1‑47 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:461264/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:574389/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:537643/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:528629/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:508019/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:49212/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:490952/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:47600/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:60775/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:444111/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:442501/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:433415/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:356046/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:338420/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:300317/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:700759/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:977741/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:969525/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:953489/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:894701/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:851680/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:779872/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:762863/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:724445/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:721534/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:177376/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:681130/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:679638/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:670177/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:665402/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:664471/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:645993/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:63590/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:60824/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1164050/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1295788/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1278950/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1272383/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1249237/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1234262/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1227123/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1182255/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1171220/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1336254/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1137183/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1121458/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1092864/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1081431/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1073426/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1070618/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1016937/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1516501/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:268382/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1009158/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:164994/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1602255/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1591910/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1590758/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1572454/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:293552/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1472622/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1442137/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1434139/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1422711/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1400642/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:1372625/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  >  1:136508/1‑48 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAg  <  1:1359169/48‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGACAACTATCAg  >  1:1036118/1‑48 (MQ=255) |                                                TTGTCCGATTTCCCATTCTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAG  >  W3110S.gb/1756840‑1756887

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑