Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1908897	1909888	992	177 [0]	[0] 85	cspC–yobF	cspC,yobF

TGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAC  >  W3110S.gb/1909889‑1909957 |                                                                     tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGTATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:164628/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATTAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1311155/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGTGGTTAc  <  1:237218/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:565349/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:597054/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:565324/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:547157/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:516163/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:474032/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:438149/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:413162/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:393588/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:366900/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:363595/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:361548/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:360296/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:331567/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:300836/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:298503/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:277726/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:271205/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:258604/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:256440/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:736239/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:948075/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:906664/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:871270/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:847732/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:836936/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:821000/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:816896/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:787512/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:782664/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:761714/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:231782/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:694211/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:690295/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:683660/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:681851/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:66090/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:652450/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:65011/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:648639/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:642089/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1193350/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1413663/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1370870/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1343555/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1320145/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1309713/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1309599/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1278327/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1272954/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1216801/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1201817/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1422393/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1171199/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1145091/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1133462/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1103572/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1071778/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1056026/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1048076/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1009828/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1005962/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1516414/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1003180/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:229973/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:225285/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:190923/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1585685/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:155964/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1544429/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1541664/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1534003/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:241439/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1512191/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1507241/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1493071/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1453368/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1452698/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1443620/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1441696/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1422815/69‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGCAACCCTTCAACGACGGGGTTAc  <  1:1432486/69‑1 (MQ=255) |                                                                     TGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAC  >  W3110S.gb/1909889‑1909957

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑