Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1982638	1983228	591	86 [0]	[0] 82	otsA	trehalose‑6‑phosphate synthase

AGCAAGGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCAGAAAGAA  >  W3110S.gb/1983229‑1983296 |                                                                    agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCataaagat  <  1:207419/68‑2 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:444140/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:575487/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:559256/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:541596/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:540663/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:524415/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:514406/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:491720/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:462839/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:450248/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:448345/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:583137/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:440174/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:436142/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:422779/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:404065/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:400830/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:38143/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:370055/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:353549/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:683104/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:971094/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:930953/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:925917/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:922845/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:889363/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:872741/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:843780/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:798892/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:763510/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:7614/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:302680/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:680968/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:664313/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:659535/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:654249/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:647182/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:645208/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:632012/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:615181/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:600886/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1195676/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1435528/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1428701/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1417584/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1406052/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1399808/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1339322/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1282262/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1275663/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1233222/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1475118/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1179997/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1166695/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1153280/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1127159/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1117623/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1115892/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1111718/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1109375/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1059467/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:16549/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:298298/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:276321/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:275284/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:234310/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:217976/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:203122/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:202337/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:200927/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:199159/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1002035/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1592320/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1569339/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1561549/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:155299/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1531819/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1521639/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1502464/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCagaaagaa  <  1:1497034/68‑1 (MQ=255) agcaagGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAACATGCagaaagaa  <  1:1541785/68‑1 (MQ=255) |                                                                    AGCAAGGTGTCATATGTCGGCAGCGCGTTGAAGATTTCCGGTGTCGGGAAAGGAATATGCAGAAAGAA  >  W3110S.gb/1983229‑1983296

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑