Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1996608	1996620	13	55 [0]	[0] 70	uvrC	excinuclease UvrABC, endonuclease subunit

TTTCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGAA  >  W3110S.gb/1996621‑1996688 |                                                                    tttCTGTGTGAGTAACCTTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1547052/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGTGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1029951/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:496294/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:682903/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:645836/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:643161/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:633454/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:628441/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:613771/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:561055/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:513522/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:979475/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:358089/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:47283/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:413951/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:395873/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:380668/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:376096/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:369038/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:82346/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1005025/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:952694/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:951894/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:948866/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:942768/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:922570/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:839524/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:837778/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:693058/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:755480/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:753708/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:740354/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:725966/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:71314/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:704747/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:697300/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:117181/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:348360/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1335451/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1331554/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1314301/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1298843/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:128416/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1217737/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1184480/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1343473/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:116489/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1142184/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1124716/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1099571/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:109405/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:109115/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:104966/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1448567/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:346602/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:268751/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:264627/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:221960/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:174540/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1604432/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1583466/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:14504/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1345257/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1443562/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1436699/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1434924/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1434480/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1432888/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGaa  <  1:1348582/68‑1 (MQ=255) tttCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGATTTGCGCGaa  <  1:1233239/68‑1 (MQ=255) |                                                                    TTTCTGTGTGAGTAACCGTTACATCAATTTGCTGGATCTGGGCGACCAGCGCTTCGGTTTTGCGCGAA  >  W3110S.gb/1996621‑1996688

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑