Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2008218	2008228	11	68 [0]	[0] 25	fliT/amyA	predicted chaperone/cytoplasmic alpha‑amylase

GATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCG  >  W3110S.gb/2008229‑2008297 |                                                                     gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:260453/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:960815/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:958865/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:940490/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:824904/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:760922/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:595535/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:535078/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:439342/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:391891/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:37340/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:354281/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:294898/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1005967/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1589799/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1584252/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1559585/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1495025/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1443893/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1196214/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:117946/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1087973/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:107763/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1012132/69‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCATGAATGGAGTCGAAGAATGCg  <  1:1428807/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCG  >  W3110S.gb/2008229‑2008297

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑