Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2073458 2073459 2 148 [0] [0] 297 yeeP/flu CP4‑44 prophage region; ECK1991:JW5327:b1999; predicted GTP‑binding protein/antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

Only 100 of 297 total aligned reads displayed.

TATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGA  >  W3110S.gb/2073460‑2073528
|                                                                    
tatataTTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:915261/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaataat                           >  1:734448/1‑44 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaataa                            >  1:1438562/1‑43 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaata                             >  1:577193/1‑42 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaata                             >  1:1063387/1‑42 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAAGATGCACAGa  >  1:593507/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGcaca    >  1:1296741/1‑67 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg   >  1:1010743/1‑68 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg   >  1:326578/1‑68 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg   >  1:1490268/1‑68 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg   >  1:1240351/1‑68 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg   >  1:882626/1‑68 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg   >  1:1094990/1‑68 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:543020/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:636502/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:968822/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:605431/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:973162/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:977997/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:589840/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:582610/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1001842/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:557462/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:654261/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:536625/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:516582/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:508855/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:474381/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:455235/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:444428/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:412266/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:399217/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:354605/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:993050/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:751337/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:900730/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:925481/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:848744/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:834007/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:81228/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:789574/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:931184/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:781782/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:761379/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:908540/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:94257/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:744390/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:727579/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:714114/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:709504/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:700470/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:686237/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:678529/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:663061/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:119424/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1369310/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1355147/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1334694/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1319738/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1276203/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1258472/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1247112/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1233300/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1220257/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1212163/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1206687/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:138050/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1178022/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1169638/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1161990/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1153889/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1125202/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1110557/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1082208/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1044146/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1031704/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1024231/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1393019/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:299090/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:262620/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:24166/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:22703/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:216489/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:199499/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:192018/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:162181/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:159150/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1559220/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1546496/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1529448/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1519071/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1460175/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1444575/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1434546/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1429918/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1422559/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1416804/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1403205/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:314254/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGAACGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:368699/1‑69 (MQ=255)
|                                                                    
TATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGA  >  W3110S.gb/2073460‑2073528

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑