Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2111245	2111358	114	68 [0]	[1] 73	rfbX	predicted polisoprenol‑linked O‑antigen transporter

GACCATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGT  >  W3110S.gb/2111357‑2111427   |                                                                     gACCATATAATTACGGCATGCT‑‑TTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1600182/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:443921/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:592903/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:589190/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:556568/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:537017/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:490025/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:485429/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:459960/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:459590/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:45013/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:598605/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:431609/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:418318/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:410944/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:394725/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:390459/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:385348/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:380844/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:818822/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:997952/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:949563/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:93949/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:901392/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:885955/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:883406/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:836813/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:829819/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:278394/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:790558/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:738559/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:728494/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:701672/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:681042/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:672413/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:652703/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:622940/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1169569/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1356253/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1349213/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1348994/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1308294/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1305775/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1256612/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1251666/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:11941/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1003175/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1138668/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1123667/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:111025/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1106796/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1088547/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1077636/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1042779/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1039016/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1389318/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:322392/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:264239/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:231455/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:213636/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:206354/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:169141/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:160638/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1576210/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1552431/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1524741/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1466958/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1453997/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1446849/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1444200/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1427593/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1375723/69‑1 (MQ=255)   ccATATAATTACGGCATGCTCGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGt  <  1:1026382/69‑1 (MQ=255)   |                                                                     GACCATATAATTACGGCATGCTTGTTATATTCAGGAACAAGCAAGGTCATCGACGTTAAGAAAATCAATGT  >  W3110S.gb/2111357‑2111427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑