Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2164038	2164616	579	85 [1]	[0] 42	mdtD	multidrug efflux system protein

GGTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGTTTTT  >  W3110S.gb/2164617‑2164685 |                                                                     ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:517631/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1028471/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:23969/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:256021/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:353156/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:41842/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:428167/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:430440/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:441262/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:443216/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:491867/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:23168/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:633512/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:651762/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:674438/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:717635/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:720763/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:722149/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:731848/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:817243/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:960797/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1339359/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1044539/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1137020/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1239500/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1240686/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1263758/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1281014/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1289230/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1320053/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1336104/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:228610/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1433733/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:14638/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1466992/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1503044/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1521967/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1538546/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:1552390/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:191240/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:226373/69‑1 (MQ=255) ggTCACCCTCTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGttttt  <  1:553940/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GGTCACCCTGTTGTTTATGACTACCGCCCTGCTGGGCTGGTACTACGTTTTGCCGTTCGTCCTGTTTTT  >  W3110S.gb/2164617‑2164685

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑