Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2317357 2317402 46 167 [0] [0] 48 rcsD phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

TGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACTT  >  W3110S.gb/2317403‑2317459
|                                                        
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCAtt      >  1:303683/1‑53 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:633022/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1032047/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:265743/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:337144/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:364463/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:378364/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:414728/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:432550/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:48365/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:628551/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:632555/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:250488/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:667219/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:673445/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:741255/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:74815/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:860488/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:918723/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:929664/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:931910/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:947655/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:964534/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:983639/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1307194/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1047032/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:10547/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1058018/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1063421/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1075161/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1125640/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:128041/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1304140/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1304761/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:236629/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1391281/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1448584/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1465402/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1506085/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1507223/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1511414/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1530600/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1554846/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1604504/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:222519/1‑57 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACt   >  1:847114/1‑56 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACt   >  1:1256586/1‑56 (MQ=255)
tGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGACTGGCAGAACGGTCATTACtt  >  1:1422758/1‑57 (MQ=255)
|                                                        
TGAACGCGAAAGCTTTTCTAACATGCGCCGCCTGGCCTGGCAGAACGGTCATTACTT  >  W3110S.gb/2317403‑2317459

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: