Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2336441	2336463	23	221 [1]	[0] 75	yfaS yfaS	ECK2220:JW2222+JW2221:b4500; hypothetical protein ECK2220:JW2222:b2228; hypothetical protein, N‑ter fragment

TCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGGC  >  W3110S.gb/2336464‑2336532 |                                                                     tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCTCCAGgc  <  1:205370/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:450516/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:589441/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:585875/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:548294/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:546100/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:489616/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:487153/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:480280/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:470325/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:468013/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:600806/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:44546/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:417196/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:394914/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:365211/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:309760/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:293241/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:2849/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:725928/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:94202/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:914558/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:862222/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:858279/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:844618/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:823118/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:809070/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:776282/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:72844/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:248914/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:718979/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:706404/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:687103/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:678133/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:661936/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:635918/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:633003/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:626777/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1172107/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1348684/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1342338/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1320865/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1304946/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1237962/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1205632/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1197358/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1190825/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1173555/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1378500/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1150499/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1149252/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1149048/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1139979/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:113482/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1108123/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1067642/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1024079/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1583207/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1000128/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:246426/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:242924/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:215957/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:215227/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:200534/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:160331/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1596329/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:282686/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1578742/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1480464/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1476496/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1431117/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1413283/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1411303/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1406413/69‑1 (MQ=255) tCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGgc  <  1:1392949/69‑1 (MQ=255) |                                                                     TCCACCTCTTCACGCCGTGGACGTTCAAGCATTTTTACTCGCCGCTCGCTGCGGTTAGTTGCGCCAGGC  >  W3110S.gb/2336464‑2336532

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑