Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2399480	2399674	195	58 [0]	[0] 70	nuoL	NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit L

GCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATG  >  W3110S.gb/2399675‑2399743 |                                                                     gCCAATCAATGGCAAATTAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGGATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1459231/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGACTCGATg  <  1:1094668/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGAta  <  1:1579388/69‑2 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:545060/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:672221/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:666240/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:650825/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:618408/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:615885/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:57450/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:574300/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:696590/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:45932/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:453743/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:427447/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:423128/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:418717/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:416660/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:400193/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:398391/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:805904/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:989906/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:979161/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:971140/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:891012/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:864924/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:857805/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:832413/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:82595/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:680841/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:792076/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:791067/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:777200/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:769249/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:730146/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:719633/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:329336/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1496143/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1028433/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1050912/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1079955/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1101404/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1154383/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1156795/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1163024/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1199129/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1244779/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1304164/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1359251/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1432430/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1465825/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:148232/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1487015/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:195028/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1024980/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:313444/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:275105/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:273231/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:210313/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:210162/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:208434/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:38009/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:171051/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1590244/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1588550/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1579955/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1541937/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1536084/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATCGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:1371742/69‑1 (MQ=255) gCCAATCAATAGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATg  <  1:319534/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GCCAATCAATGGCAAAATAATGGTTAAGGCAAGCATGTTCATCCGCGCATCTCACTTACTGAATCGATG  >  W3110S.gb/2399675‑2399743

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑