Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	161789	161878	90	66 [0]	[0] 19	ligT	2'‑5' RNA ligase

TTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGA  >  W3110S.gb/161879‑161946 |                                                                    ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTccc               >  1:132142/1‑55 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGcc            >  1:892979/1‑58 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:400873/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:991202/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:769591/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:745579/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:741839/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:737701/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:635715/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:497719/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:451564/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:1018405/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:31248/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:292288/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:1475186/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:1391166/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:134010/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:1337443/1‑68 (MQ=255) ttCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGa  >  1:1024458/1‑68 (MQ=255) |                                                                    TTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGA  >  W3110S.gb/161879‑161946

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑