Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2641047	2641497	451	39 [0]	[0] 37	yfgA	conserved hypothetical protein

CATTCGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGA  >  W3110S.gb/2641498‑2641566 |                                                                     cattcGCTGGAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATTCCGGAGAACcat                      >  1:657617/1‑49 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGCTGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACcgcg   >  1:610858/1‑68 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCg                               >  1:84330/1‑40 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACcgcg   >  1:1375145/1‑68 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACcgcg   >  1:556706/1‑68 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACcgcg   >  1:1469807/1‑68 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:7313/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:1009133/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:61381/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:622970/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:969640/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:672663/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:681891/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:700865/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:95336/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:99046/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:914577/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:918174/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:951076/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:952854/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:256058/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:1085261/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:111379/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:1153697/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:133886/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:1433585/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:144956/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:1540662/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:244108/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:578156/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:293996/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:342181/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:431089/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:469119/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:511989/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:5299/1‑69 (MQ=255) cattcGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGa  >  1:567961/1‑69 (MQ=255) |                                                                     CATTCGCTGCAGGTACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGA  >  W3110S.gb/2641498‑2641566

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑