Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2663868	2664155	288	47 [0]	[0] 68	[yfhR]–[csiE]	[yfhR],[csiE]

GACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGATGATGA  >  W3110S.gb/2664156‑2664224 |                                                                     gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:562297/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:675025/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:667118/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:666092/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:635005/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:608706/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:596333/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:573719/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:571225/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:679833/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:529453/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:51312/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:483075/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:466158/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:452421/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:427596/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:402901/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:846010/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:975534/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:969763/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:959642/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:951225/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:93387/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:88135/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:878967/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:86462/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:358494/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:818232/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:803245/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:797561/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:786406/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:766562/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:717622/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:704588/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1165371/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1333676/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1322157/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1290868/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1245816/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1237668/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:118248/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1175105/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1168031/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1349736/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1161924/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:115080/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1145676/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1075961/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1034200/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1021879/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1011840/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1580957/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:332456/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:309563/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:303438/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:230831/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:227346/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1605945/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1585128/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1005139/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1544519/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1459156/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1456795/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1389467/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:138558/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1361916/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:1358315/69‑1 (MQ=255) gACGCTCTTTCAGCCGGGGATGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGgatgatga  <  1:3086/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGATGATGA  >  W3110S.gb/2664156‑2664224

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑