Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2664509	2664567	59	52 [0]	[0] 71	csiE	stationary phase inducible protein

TTGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTG  >  W3110S.gb/2664568‑2664635 |                                                                    ttGCTGCAGCACTACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1459585/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:54240/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:66615/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:634331/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:628072/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:601560/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:573975/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:572984/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:546201/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:681620/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:525741/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:50122/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:437859/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:422868/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:421920/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:413360/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:39522/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:385720/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:774560/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:991253/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:922164/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:893557/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:856048/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:837814/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:801278/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:799822/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:790270/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:373523/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:771808/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:766204/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:760202/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:731760/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:710720/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:701269/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:696138/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1175619/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1030290/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1391974/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1366186/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1359465/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1346726/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1337514/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1308713/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1199436/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1417555/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1164713/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1141104/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1134298/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1130047/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1127525/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:10978/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1094559/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:264275/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:350105/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:34215/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:322273/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:294394/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:273886/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:270411/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:268205/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1464686/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:254427/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:217896/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1603798/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:157093/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1568379/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1523973/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:1484642/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCATg  <  1:949784/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGGCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:140472/68‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTAAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTg  <  1:456258/68‑1 (MQ=255) |                                                                    TTGCTGCAGCACCACGCTGGAATTACGCCTCAGTTTAATCCGCTCCAACGTCGCTGGGCGGAATCCTG  >  W3110S.gb/2664568‑2664635

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑