Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2774553	2774581	29	194 [0]	[0] 74	[yfjX]	[yfjX]

CACAGACACAGTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCG  >  W3110S.gb/2774582‑2774650 |                                                                     cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:473458/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:761796/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:720827/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:651484/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:651239/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:608289/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:566026/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:539612/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:503324/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:492060/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:764670/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:461425/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:46024/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:448252/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:403812/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:389551/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:384975/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:351697/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:293180/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:893660/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:98590/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:982934/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:95212/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:943120/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:930618/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:926609/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:907897/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:905190/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:284079/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:868617/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:841615/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:828414/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:821492/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:820503/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:819746/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:794879/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:783934/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1133292/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:127565/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1267452/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1267253/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1261655/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1239561/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1231786/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1187769/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1175693/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1168243/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1313316/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1124273/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1060241/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1051242/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1042229/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1034711/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1034151/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1032174/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1031770/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1522897/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:281058/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:243701/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:232421/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:20898/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:193271/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:192909/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:180963/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1563696/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1008798/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1469325/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1466832/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:144225/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1399731/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1392764/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1357402/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1333349/69‑1 (MQ=255) cacagacacagTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCg  <  1:1314049/69‑1 (MQ=255) |                                                                     CACAGACACAGTACGACCTCGTACCCGCTAACGGATCCGAATTTGAGTTGAGCGTAACGCAGGTACCCG  >  W3110S.gb/2774582‑2774650

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑