Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2783865	2784358	494	118 [0]	[0] 56	ypjC/ileY	hypothetical protein/tRNA‑Ile

TAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCT  >  W3110S.gb/2784359‑2784427 |                                                                     taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:688519/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1008877/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:349653/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:351516/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:381940/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:41307/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:435721/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:477701/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:520916/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:524862/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:544066/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:607378/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:607678/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:609302/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:333534/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:723306/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:747910/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:771184/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:807042/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:840832/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:848329/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:848776/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:864450/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:867369/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:907133/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:939449/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:941285/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:9732/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1511675/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1009979/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1080455/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1096412/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1180046/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1229175/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1229807/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1234930/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1285535/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1297749/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1326579/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1394900/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:141461/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:316189/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1531197/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1541517/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1566698/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:1592756/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:16606/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:176971/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:191041/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:202322/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:211111/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:28280/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:293571/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:306259/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:313835/69‑1 (MQ=255) taGACCGCCATCGAGTACCCCT‑‑TACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCt  <  1:823287/67‑1 (MQ=255) |                                                                     TAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCT  >  W3110S.gb/2784359‑2784427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑