Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2813237	2813492	256	155 [0]	[0] 78	[luxS]	[luxS]

CAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCCACA  >  W3110S.gb/2813493‑2813561 |                                                                     cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:440345/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:600119/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:597385/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:586710/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:552456/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:531310/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:522625/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:506749/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:476085/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:459933/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:629400/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:434866/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:429233/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:394499/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:385229/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:374119/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:314003/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:310693/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:270318/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1028653/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:82173/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:986735/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:962479/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:948059/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:904569/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:901862/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:897772/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:864172/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:835963/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:822690/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:220803/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:79438/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:786366/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:778061/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:768281/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:719130/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:700683/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:693268/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:651298/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1147220/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1299520/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1287452/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1285594/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1274545/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1267935/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:124950/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:124581/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1238962/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:115970/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1306299/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1138444/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1134810/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1118042/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1106132/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1103396/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1080140/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1077204/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1039877/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1510282/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:173457/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:165473/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:164519/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:160021/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1597436/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1582681/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1570565/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1559629/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:217676/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1490412/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1431035/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1415339/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1406018/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1397427/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:138449/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1353912/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1345429/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCcaca  <  1:1340803/69‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGGTTTTCCAGCcaca  <  1:853965/69‑1 (MQ=255) |                                                                     CAGAGATGAAATTTTGGCCACTCACGAGTGGCCTTTTTCTTTTCTGTCAGGCGTGTTTTTCCAGCCACA  >  W3110S.gb/2813493‑2813561

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑