Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2858754	2859473	720	45 [0]	[0] 60	[pphB]–[ygbI]	[pphB],[ygbI]

AATAATTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGTTT  >  W3110S.gb/2859474‑2859528 |                                                       aataatTGTGCAATTTCTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:550999/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCTAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1453981/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:742381/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:475133/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:505220/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:526647/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:537233/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:538923/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:546104/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:559563/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:575791/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:606193/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:608266/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:622344/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:628366/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:686946/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:693899/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:408788/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:779045/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:832319/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:847846/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:86923/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:875063/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:877032/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:887469/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:893543/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:899143/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:902172/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:92005/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:940228/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:941482/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1554036/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1134132/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1137979/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1178479/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1214685/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:122095/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1289737/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1336623/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:133683/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1351786/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:139240/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1456352/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1468177/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1511341/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1535014/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1044867/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1580890/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:1592115/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:182353/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:220480/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:246854/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:259846/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:272125/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:30963/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:326647/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:335840/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:367214/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:393794/55‑1 (MQ=255) aataatTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGttt  <  1:395401/55‑1 (MQ=255) |                                                       AATAATTGTGCAATTACTGTTGTCGAGCAAGTAGTCCGCAATAACGAAATCGTTT  >  W3110S.gb/2859474‑2859528

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑