Missing coverage evidence...
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CACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCATG  >  W3110S.gb/2860042‑2860110 |                                                                     cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGTGATCTGAGTTTCAta  >  1:375616/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:465094/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:947063/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:895598/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:873092/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:872690/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:850730/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:801538/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:801238/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:799580/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:736268/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:732174/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:718345/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:713086/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:707197/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:670291/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:1054113/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:435501/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:366641/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:334072/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:294836/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:268685/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:225292/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:1598359/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:1468474/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:1461552/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:1377518/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:1219655/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAta  >  1:1079009/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAt   >  1:839817/1‑68 (MQ=255) cacaATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCAt   >  1:1315666/1‑68 (MQ=255) |                                                                     CACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCATG  >  W3110S.gb/2860042‑2860110

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑