Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2903715	2904082	368	16 [0]	[1] 43	[ygcF]	[ygcF]

CTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGT  >  W3110S.gb/2904081‑2904150   |                                                                    ctctGT‑AAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:733611/69‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAGTTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:631724/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:52314/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1599141/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:164608/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:188944/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:209876/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:247140/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:318400/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:355060/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:37327/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:476857/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:503915/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:148408/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:625400/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:696698/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:718642/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:827385/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:831617/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:847911/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:878163/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:988055/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1238569/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1028220/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1094191/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1103247/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1103674/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1111632/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1124882/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1125496/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1132467/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1236026/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1009942/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1259220/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1270525/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1322991/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1324245/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1335661/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:135130/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:135213/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:13562/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1388831/68‑1 (MQ=255)   ctGTGAAGGGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGt  <  1:1077677/68‑1 (MQ=255)   |                                                                    CTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGT  >  W3110S.gb/2904081‑2904150

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑