Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2992513	2992570	58	42 [0]	[0] 94	ygeI/pbl	hypothetical protein/ECK2852:JW5457:b2854; predicted peptidoglycan‑binding enzyme

TTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTG  >  W3110S.gb/2992571‑2992638 |                                                                    ttccATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:842599/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCAGACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:351103/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAGAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:134271/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTTAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:275948/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTTTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:676165/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCAGGTTTTg  <  1:207168/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGttttt  <  1:855874/68‑2 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:528702/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:588885/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:525327/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:506661/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:499392/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:497923/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:467384/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:459982/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:401755/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:375212/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:358711/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:333868/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:320198/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:303681/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:299499/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:272848/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:254434/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:234787/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:224229/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:814898/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:960311/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:956063/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:914062/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:896990/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:887337/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:885006/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:846232/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:830360/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:825999/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:818964/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:545953/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:806944/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:791148/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:789525/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:781591/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:777900/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:68537/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:632744/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:599483/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:218974/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1203875/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1011991/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1313376/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1312113/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1298388/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1281592/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1263174/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1261379/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1240969/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1233038/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1229057/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1226254/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1334089/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1170692/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1160169/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1145952/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1102799/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1097469/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1094068/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1080492/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:107322/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1065273/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:102345/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:154784/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:213227/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:204894/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:19613/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:179923/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1596487/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:159607/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1587041/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1574588/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1564762/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1562533/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1548881/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1342475/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1541380/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1494065/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1472718/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1441454/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1408682/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1408176/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1390770/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1388560/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:1348349/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCTCACACATGAAAAAATATGCACTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:769883/68‑1 (MQ=255) ttcaATCCACACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg  <  1:810898/68‑1 (MQ=255) |                                                                    TTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTG  >  W3110S.gb/2992571‑2992638

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑