Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3079474	3079500	27	202 [0]	[0] 85	tktA	transketolase 1, thiamin‑binding

GGCGCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATC  >  W3110S.gb/3079501‑3079569 |                                                                     ggcgCACCGTGGGAGTCGTTGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:827405/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGTGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:687473/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTTCACATc  <  1:3515/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACCTc  <  1:685004/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:584302/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:642814/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:583282/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:562224/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:553310/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:548621/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:536166/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:534312/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:526434/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:516626/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:493354/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:476704/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:471550/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:460366/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:449771/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:442031/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:427579/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:397662/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:386933/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:822143/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1063097/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:901990/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:895167/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:890924/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:885711/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:880255/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:878312/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:828666/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:822461/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:593157/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:798118/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:779526/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:772100/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:739188/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:714896/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:714078/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:647206/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:956294/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:598511/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1249618/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1436290/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1420662/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:141162/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1369806/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1363167/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1339/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1305520/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1274500/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1266870/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:125341/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1436869/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1224000/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1208094/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1207940/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1175841/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1162599/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1158724/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:114013/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1109747/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1108978/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:158380/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:25496/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:242121/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:230207/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:226889/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:219443/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:195820/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:181050/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:161932/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1604226/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1599115/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:368978/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1583546/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1568185/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1531567/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1483435/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1470627/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1469356/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1456649/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1454453/69‑1 (MQ=255) ggcgCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATc  <  1:1438671/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GGCGCACCGTGGGAGTCGTGGGTACCGGCTTTGTTCGGGGAACCGAAACCGATGATGGTTTTGCACATC  >  W3110S.gb/3079501‑3079569

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑