Missing coverage evidence...
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CATTTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCA  >  W3110S.gb/3123027‑3123075 |                                                 cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGc           >  1:1378533/1‑40 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGt         >  1:957774/1‑42 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACg    >  1:728335/1‑47 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:876996/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:828875/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:814246/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:755851/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:752186/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:293784/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:645764/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:882133/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:547473/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:545275/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:507240/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:443429/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:428237/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:415208/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:393498/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1011486/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:266444/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:213014/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:144750/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1445591/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1404943/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1369882/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1338860/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1329155/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1197210/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1189973/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1085149/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1083361/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1029858/1‑49 (MQ=255) cattTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCa  >  1:1025136/1‑49 (MQ=255) |                                                 CATTTTGTTATCCCGCAGCTGGCGTGCCAGATCGGGATGCGTTAACGCA  >  W3110S.gb/3123027‑3123075

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑