Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3138707	3139276	570	138 [4]	[0] 94	[hybF]–[hybE]	[hybF],[hybE]

CACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAT  >  W3110S.gb/3139277‑3139344 |                                                                     cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGCCCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:351191/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACa                               >  1:1582671/1‑40 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAAATCAGAAACATACACCGGCa   >  1:470117/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAAc              >  1:347540/1‑56 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATaca         >  1:437166/1‑61 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATac          >  1:744088/1‑60 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:587170/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:702725/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:699699/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:679458/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:661482/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:66066/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:64989/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:647676/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:647523/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:627619/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:624213/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:704569/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:55446/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:510576/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:509689/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:504275/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:43546/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:427159/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:425218/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:410674/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:829526/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:970064/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:958464/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:954012/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:938129/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:935007/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:900683/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:89440/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:8884/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:885561/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:873676/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:872051/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:368860/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:807971/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:802274/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:801678/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:797030/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:789197/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:783261/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:725264/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:716495/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:706679/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:706041/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1363745/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:15253/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1505549/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1503719/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1483245/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1482666/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1470974/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1456315/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1444815/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1386868/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1386563/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1365191/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1525410/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1313951/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1288289/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1285927/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1257216/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:124494/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1133125/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:110392/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1099804/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1093372/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1042659/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:258340/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1000279/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:355029/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:347080/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:325869/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:312788/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:287279/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:287249/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:284748/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:278864/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:259425/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:371977/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:256709/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:24136/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:240442/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:23126/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:206684/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:193594/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:184868/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:16699/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:158858/1‑68 (MQ=255) cACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAt  >  1:1575780/1‑68 (MQ=255) |                                                                     CACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGT‑AAAATCAGAAACATACACCGGCAT  >  W3110S.gb/3139277‑3139344

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑