Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	235425	236009	585	161 [0]	[0] 95	[yafS]–rnhA	[yafS],rnhA

AGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCA  >  W3110S.gb/236010‑236078 |                                                                     aGACTTCCTGTTATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:363487/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATATATGAc                  >  1:1507510/1‑53 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGAGCGCTATGAGCACTGCa  >  1:436521/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTa             >  1:1320937/1‑58 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTa             >  1:1177471/1‑58 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGc   >  1:604397/1‑68 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGc   >  1:361614/1‑68 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGc   >  1:718706/1‑68 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGc   >  1:475628/1‑68 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:446337/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:59951/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:530236/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:521415/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:506165/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:500156/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:499755/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:463061/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:607515/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:431098/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:406096/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:371551/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:338533/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:318049/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:269743/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:248207/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:221668/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:868674/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:993754/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:981226/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:973976/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:942371/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:923600/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:887114/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:886801/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:884819/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:883887/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:874883/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:204418/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:853181/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:836651/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:80/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:764280/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:737221/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:7258/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:712008/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:670574/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:665148/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:654318/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1159319/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1311045/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:213666/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:130637/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1285394/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1252456/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1227368/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:122201/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:117986/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1169223/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1166875/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1307604/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1122720/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1108671/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1107165/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:110218/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1081763/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1041944/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:103397/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1032660/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:102684/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1013003/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1432591/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1012370/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:196830/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:174176/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1602356/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1594747/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1578602/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1529444/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1529421/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1495901/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1455912/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1453436/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1449399/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1332740/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1424659/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1413554/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1398360/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1366165/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1363154/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1361109/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATCAGCACTGCa  >  1:508039/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATCGAACAGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:704226/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAATTGAATAGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1289262/1‑69 (MQ=255) aGACTTCCTGTAACTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1268465/1‑69 (MQ=255) aGACTTACTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCa  >  1:1177/1‑69 (MQ=255) |                                                                     AGACTTCCTGTAATTGAATCGAACTGTAAAACGACAAGTCTGACATAAATGACCGCTATGAGCACTGCA  >  W3110S.gb/236010‑236078

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑