Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3169240 3169766 527 66 [0] [0] 39 qseC sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with QseB

CGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAT  >  W3110S.gb/3169765‑3169832
  |                                                                 
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCTGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:668436/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:56109/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:234368/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:256243/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:334741/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:408216/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:437705/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:441405/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:443928/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:479810/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:519602/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:219111/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:645969/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:671600/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:796570/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:819023/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:958582/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:959103/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:961027/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:991355/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1586141/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1102912/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1111288/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1114179/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1134761/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:114630/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1207681/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1389962/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1405460/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1476500/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1089421/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:1589806/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:168395/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:169161/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:176579/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:18242/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:182434/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:197457/66‑1 (MQ=255)
gaaCTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGACGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAt  <  1:181268/66‑1 (MQ=255)
  |                                                                 
CGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACAT  >  W3110S.gb/3169765‑3169832

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: