Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3288066 3288166 101 45 [0] [0] 110 yraI predicted periplasmic pilin chaperone

Only 100 of 110 total aligned reads displayed.

ACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAC  >  W3110S.gb/3288167‑3288235
|                                                                    
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGCTGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1158419/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACtc                                 >  1:1517442/1‑38 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTaaa              >  1:31310/1‑57 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAg          >  1:290810/1‑61 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTg       >  1:807731/1‑64 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTTATAAc  >  1:1094761/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATaa   >  1:224662/1‑68 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATaa   >  1:1117513/1‑68 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATa    >  1:737234/1‑67 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:649517/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:622512/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:659287/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:666280/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:68273/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:698519/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:709561/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:723870/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:727438/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:628372/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:623746/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:757063/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:61109/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:578270/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:572366/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:54719/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:522848/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:521251/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:500720/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:498085/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:491844/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:870930/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:970838/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:961374/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:954769/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:929361/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:913550/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:905956/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:903541/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:895479/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:894873/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:885915/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:879370/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:730115/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:855673/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:851604/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:851256/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:822450/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:815345/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:80483/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:802104/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:76961/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:763676/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:763565/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:393310/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1255551/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1455671/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1455217/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1448507/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1416500/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1391989/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1326138/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1280476/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1276377/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1274750/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1263736/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1261040/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1468495/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1243536/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1202292/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1157602/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1134296/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1122297/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1104222/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:109904/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1092046/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1091775/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1033096/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:243274/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:451498/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:401756/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1016826/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:310382/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:308941/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:297092/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:293435/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:284580/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:280487/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:273662/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:25419/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:471824/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:210307/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:202348/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:198557/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:196515/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:173087/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:153910/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1488210/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1478177/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAc  >  1:1470964/1‑69 (MQ=255)
aCCCCACCGCTATTACGTCTTGACCCTGGCGATGACTCATCACTGAGaa                      >  1:154589/1‑49 (MQ=37)
|                                                                    
ACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCGATGACTCATCACTGCGAATTATTAAAACAGCTGATAAC  >  W3110S.gb/3288167‑3288235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑