Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3359998	3360034	37	210 [0]	[0] 44	gltD	glutamate synthase, 4Fe‑4S protein, small subunit

CCCGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTA  >  W3110S.gb/3360035‑3360103 |                                                                     cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGGGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:49915/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:676980/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:463592/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:481615/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:493245/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:503316/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:516715/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:517452/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:55728/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:557440/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:583392/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:434512/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:684192/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:758836/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:818603/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:8527/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:906977/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:909274/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:953441/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:982599/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:983318/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:988520/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1495148/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1074423/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1209908/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:121813/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1231437/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:126400/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1269002/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1284789/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1394391/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1395910/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:141746/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1039482/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1505088/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1581498/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1585091/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:1594290/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:177610/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:215135/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:259099/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:298203/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:303429/69‑1 (MQ=255) cccGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTa  <  1:314199/69‑1 (MQ=255) |                                                                     CCCGCCGCGAAGTGAAAAACGCGCGGGAAGAAGGCGTAGAGTTCAAATTCAACGTCCAGCCGCTGGGTA  >  W3110S.gb/3360035‑3360103

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑