Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3416640	3416722	83	213 [1]	[0] 84	acrF	multidrug efflux system protein

CGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAAG  >  W3110S.gb/3416723‑3416790 |                                                                    cGGGTTTAGCTTCAGGGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1171658/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:555195/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:71732/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:644537/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:624897/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:614933/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:614798/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:600146/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:596755/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:590648/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:589079/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:581057/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:719448/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:549434/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:543798/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:481701/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:477666/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:466766/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:466511/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:465534/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:459574/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:446537/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:85073/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:995977/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:987815/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:982354/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:967681/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:9534/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:918067/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:891708/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:865963/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:854194/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:30700/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:837987/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:836146/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:804811/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:784481/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:746626/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:735853/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:734392/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:729102/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:728673/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1201450/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1002429/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:133204/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1317892/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1317367/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1313283/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1261765/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:123117/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:122549/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1225227/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1204244/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1351983/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1150124/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1149261/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1131666/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1083456/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1080201/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1074093/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1055079/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1052568/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1051927/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1546597/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:27118/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:264707/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:250528/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:234802/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:220050/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:218134/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1603305/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1601377/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1578971/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1554217/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1377788/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1541443/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1457811/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1451722/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1436983/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1424304/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1408093/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1398400/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:1382355/68‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCAGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAag  <  1:827029/68‑1 (MQ=255) |                                                                    CGGCTTTAGCTTCAGCGGCCAGGCACAAAACGCCGGTATGGCCTTCGTCAGTCTGAAACCGTGGGAAG  >  W3110S.gb/3416723‑3416790

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑