Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3416791 3417470 680 104 [0] [0] 161 acrF multidrug efflux system protein

Only 100 of 161 total aligned reads displayed.

TCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTC  >  W3110S.gb/3417471‑3417539
|                                                                    
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTcc                                    >  1:1517915/1‑35 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAAtt                    >  1:1080602/1‑51 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTtgt            >  1:96055/1‑59 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:244065/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:1356024/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:14070/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:1423151/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:665337/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:1555092/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:5454/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:527455/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:148376/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:339160/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:350452/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:425802/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:368776/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:401972/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:1133568/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:1205822/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:45492/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:527841/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:912133/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:51693/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:497358/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:483290/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:933894/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:481102/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:475182/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:455571/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:90606/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:444547/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:950149/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:436683/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:969504/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:412012/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:411725/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:979192/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:644734/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:759454/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:79178/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:754612/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:70875/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:799368/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:696653/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:824774/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:667776/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:849655/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:772185/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:355449/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:625398/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:620796/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:616361/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:857283/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:582069/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:573259/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:895180/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1255757/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:376789/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1444857/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1431259/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1419710/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1378926/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1310000/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1308282/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1294269/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1290712/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1267176/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1465408/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1251976/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1237404/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1235431/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1222017/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1213044/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1191253/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1189003/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1048284/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1025824/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:17196/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:372436/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:365003/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1015502/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:314353/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:275171/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:25352/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:245892/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:20231/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:162178/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1588341/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1576984/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1537330/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1533944/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1496678/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1491194/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1488960/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTAGTTGtttt   >  1:682821/1‑68 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTACTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:1392628/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCCGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTc  >  1:317061/1‑69 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTACCGCTCTGCTAGCaa                      >  1:491330/1‑49 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCACGCTCCCGCTCTg                             >  1:63023/1‑42 (MQ=255)
tCGTATCAGGAACGCTTATAGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGtttt   >  1:226000/1‑68 (MQ=255)
|                                                                    
TCGTATCAGGAACGCTTATCGGGAAACCAGGCTCCCGCTCTGGTAGCAATTTCCTTTGTGGTTGTTTTC  >  W3110S.gb/3417471‑3417539

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑