Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3448450	3448855	406	124 [1]	[0] 46	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

TAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTC  >  W3110S.gb/3448856‑3448901 |                                              tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTc     >  1:35028/1‑43 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTc     >  1:25175/1‑43 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCtt   >  1:224516/1‑45 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCtt   >  1:1518805/1‑45 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:653736/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:349352/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:361091/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:377742/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:39709/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:428617/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:450518/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:502164/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:289133/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:674254/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:695145/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:715572/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:736261/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:749014/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:752398/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:891885/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:915246/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:948191/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:961741/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:965165/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1385974/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1050651/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1131050/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1152528/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1160755/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:116171/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1220900/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1259351/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:126551/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1365166/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:317190/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1493629/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1497957/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1528437/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1583272/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1585022/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1605034/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:18713/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:249140/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:274051/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc  >  1:1001304/1‑46 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATAGTCTTc  >  1:825429/1‑46 (MQ=255) |                                              TAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTC  >  W3110S.gb/3448856‑3448901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑