Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3461921	3462025	105	170 [0]	[0] 36	coaA	pantothenate kinase

CACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAG  >  W3110S.gb/3462026‑3462090 |                                                                 cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:469471/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1026788/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1578193/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1599908/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:290001/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:320184/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:349524/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:371004/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:428508/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1521950/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:478825/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:50097/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:663325/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:744484/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:839564/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:867883/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:971034/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:991651/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1273659/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1043054/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1067477/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1095714/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1096608/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1131688/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1175713/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1179247/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1259890/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1510484/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1281890/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:129329/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1324827/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1368863/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1369098/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1482433/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:1490995/65‑1 (MQ=255) cACTACAGATGGCTTCCTTCACCCAAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAg  <  1:411207/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CACTACAGATGGCTTCCTTCACCCTAATCAGGTTCTGAAAGAACGTGGTCTGATGAAGAAGAAAG  >  W3110S.gb/3462026‑3462090

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑