Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3509368	3510105	738	162 [0]	[0] 76	[yiiX]–[priA]	[yiiX],rpmE,[priA]

GATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGA  >  W3110S.gb/3510106‑3510174 |                                                                     gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCGTCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:235633/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCt        >  1:594959/1‑63 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCg   >  1:477352/1‑68 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:581268/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:654914/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:650472/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:642693/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:639754/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:622989/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:59285/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:592188/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:587879/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:668922/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:538653/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:427079/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:397240/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:390846/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:37532/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1014117/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:814121/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:987921/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:98662/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:979458/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:948598/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:93816/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:929127/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:900174/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:815604/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:365698/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:81195/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:800542/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:792829/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:771399/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:759765/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:743402/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:704178/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:672549/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1277422/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:329189/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1476121/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1457858/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1450520/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1436387/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1399630/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1364469/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1357010/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1334107/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1485771/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1267323/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1255439/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1252281/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1215679/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1198297/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1106005/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1097193/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1059651/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:172614/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:326894/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:285998/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:273151/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:27131/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:266665/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:212502/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:18599/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1487084/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1606804/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1598127/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1589101/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1553784/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1522470/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1518291/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1516938/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGa  >  1:1490094/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCATTGCCGa  >  1:529300/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCAAGCCTTGCCGa  >  1:721728/1‑69 (MQ=255) gATTGCTGCAATGGGCGGCACATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCt                   >  1:867502/1‑52 (MQ=255) |                                                                     GATTGCTGCTATGGGCGGCAGATTACTATCATCATCCGATTGGCGATGTGCTGTTTCATGCCTTGCCGA  >  W3110S.gb/3510106‑3510174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑